这是两个与name有关的固定搭配。

by name也可说成 by the name of是个中性词组，义：“名叫什么”，它放在专有名词之后，以表示你所要说明的人或物的确实名称。

in name是贬义词，表示“名义上”、“徒有虚名”之意。